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Nature頭條:日本和柬埔寨發現與新冠密切相關的冠狀病毒!
發布時間:2020-12-02 09:20:35

 再過一個月,就是新冠大流行暴發一周年了。截止到今天,全球已有58425681人感染,已有1385218因新冠肺炎死亡。 

  病毒的源頭雖然還未查明,但溯源工作一直在進行著。 

  北京時間11月24日,Nature》頭條新聞發布關于新冠病毒溯源工作的最新消息。 

  柬埔寨的一個研究團隊在一個冷藏箱里的蝙蝠中發現了一種與SARS-CoV-2(新冠病毒)密切相關的冠狀病毒。與此同時,日本的一個研究團隊報告稱,他們也在冷凍的蝙蝠糞便中發現了另一種密切相關的冠狀病毒。 

  上述兩種病毒是在中國以外發現的首個已知的新冠病毒近親,這為世界衛生組織在亞洲各地尋找新冠大流行的動物來源提供了支持。強有力的證據表明,新冠病毒起源于蝙蝠,但它是直接從蝙蝠跨種傳播給人類,還是通過中間宿主傳播的,仍然是個謎。 

  2010年在柬埔寨北部捕獲的兩只shameli菊頭蝠(Rhinolophus shameli中發現了這種病毒。該病毒的基因組還沒有完成測序,這項發現也沒有被發表,因此很難確定它對大流行的全部意義。 

  Rhinolophus shameli 

  柬埔寨巴斯德研究所的病毒學家Veasna Duong說,如果這種病毒與導致大流行的新冠病毒有非常密切的聯系,甚至是它的祖先,那么它可以提供關于新冠病毒如何從蝙蝠傳給人類的重要信息,并有助于尋找大流行的源頭。Duong領導了柬埔寨的樣本搜索,并于11月初提交給《Nature》雜志。研究人員說,要提供這樣的見解,該病毒必須與新冠病毒共享97%以上的基因組。 

  法國巴斯德研究所的病毒學家Etienne Simon Loriere說,但這種新病毒的關系可能更為疏遠,在這種情況下,對它的研究將有助于科學家們更多地了解冠狀病毒家族的多樣性。他計劃對病毒進行測序,然后將其公開分享。 

  日本研究團隊曾在2013年捕獲的一只角菊頭蝠(Rhinolophus cornutus中發現的另一種病毒Rc-o319就是這種情況。澳大利亞悉尼大學的病毒學家Edward Holmes說,根據112日發表的一篇論文,這種病毒與新冠病毒只有81%的共享基因組,這使我們很難深入了解大流行的起源。 

  越南野生動物保護協會的進化生物學家Alice Latine說,無論柬埔寨的研究團隊發現的是什么,這兩項新發現都令人興奮,因為它們證實了與新冠病毒密切相關的病毒在角菊頭蝠中也相對常見,甚至在中國境外發現的蝙蝠中也是如此。世衛組織看過柬埔寨研究團隊的一些分析,但沒有參與調查。 

  Duong說:“這就是我們要找的。這既令人興奮又令人驚訝。” 

  大流行的起源 

  浙江大學愛丁堡大學聯合學院傳染病專家Aaron Irving說:“這些發現還表明,其他尚未被發現的與新冠病毒有親緣關系的病毒可能會被儲存在實驗室的冰箱里。他計劃對儲存的蝙蝠和其他哺乳動物樣本進行新冠病毒抗體檢測。 

  東京大學的病毒學家Shin Murakami說:“我沒想到會找到新冠病毒的近親。”Murakami是在新冠大流行之后決定重新檢測冷凍動物樣本中病毒的研究團隊成員。 

  只有少數已知的冠狀病毒與新冠病毒密切相關,包括已知最接近的RaTG13。它于2013年在中國云南的中華菊頭蝠(Rhinolophus affinis中發現,該研究于今年早些時候已經發表。在2015年至2019年間捕獲的其他角菊頭蝠和穿山甲中也發現了其他幾種冠狀病毒。科學家現在知道這些病毒與新冠病毒密切相關。 

  參與柬埔寨研究團隊的美國加州大學戴維斯分校健康研究所副所長Tracey Goldstein說:“新冠病毒可能不是一種突然冒出來的全新病毒。這組病毒在我們2019年意識到它們之前可能就已經存在了。” 

  Latinne說,這些發現證實了角菊頭蝠是這些病毒的宿主。 

  柬埔寨的病毒 

  作為美國政府資助的“PREDICT”項目的一部分,Duong的團隊在柬埔寨捕獲了Shamel菊頭蝠。PREDICT項目對世界各地的野生動物進行了數十年的跟蹤調查,以尋找可能引發大流行的病毒,但于今年早些時候被特朗普政府終止。今年4月,美國國際開發署向該項目追加了300萬美元,并延長了6個月,以在老撾、馬來西亞、尼泊爾、泰國、越南和柬埔寨的實驗室冰箱中尋找動物樣本(主要是蝙蝠、穿山甲和其他動物)中發現新冠病毒的證據。這些調查的完整報告預計將在未來幾周公布。 

  Duong說,對新蝙蝠病毒的一個短片段(324個堿基對)的初步基因組測序顯示,它與新冠病毒和RaTG-13的的同一區域相似,表明這三個病毒是密切相關的。 

  Latinne說,這個區域在冠狀病毒中高度保守,經常被用來快速識別病毒是新的還是已知的。但目前還不清楚究竟是RaTG-13病毒還是新病毒與新冠病毒的關系更為密切。 

  同樣在柬埔寨巴斯德研究所工作的病毒學家Vibol Hul說,很難用這么小的片段來說明,大多數已知冠狀病毒的基因組包含約3萬個堿基對。Hul曾于2010年在一個洞穴的入口處捕獲過Shamel菊頭蝠。 

  柬埔寨巴斯德研究所的病毒學家Erik Karlsson表示,在另一項分析中,他們使用當地可用的技術對新病毒基因組的約70%進行了測序。該序列缺少有關病毒關鍵部分的信息,例如編碼冠狀病毒通常用于進入細胞的刺突蛋白(S蛋白)的基因。Duong說,對該部分進行測序將表明該病毒是否可以感染人類細胞。 

  Irving說,新病毒必須與新冠病毒至少有99%的相似度,才能成為當前大流行病毒的直接祖先。RaTG13和新冠病毒的基因組僅有4%的差異,表明它們擁有共同的祖先,但這種差異也代表了4070年的進化過程。雖然相隔數十年,但這兩種病毒非常相似,可以使用相同的受體進入細胞。細胞研究表明,RaTG13可以感染人類。 

  另一個近親 

  Duong說,在已知與新冠病毒相關的冠狀病毒中,新發現的Rc-o319似乎是關系最遠的。 

  在細胞研究中,日本研究團隊發現這種病毒不能與新冠病毒用來進入人體細胞的受體結合,這表明它不容易感染人。 

  Shin說,他的同事今年早些時候在日本捕獲了更多的蝙蝠,并計劃對它們進行冠狀病毒檢測。今年10月的時候,Hul回到柬埔寨北部的洞穴去捕捉更多的蝙蝠。 

  Holmes說:“生活在該地區的角菊頭蝠種群中可能存在更多與新冠病毒相關的冠狀病毒。希望其中一個或多個與新冠病毒密切相關,我們可以將其視為真正的祖先。” 

  

   (來源:中國生物技術網) 

  原文出處:Smriti Mallapaty. Coronaviruses closely related to the pandemic virus discovered in Japan and Cambodia[J].Nature. 23 NOVEMBER 2020. 

  鏈接:https://www.nature.com/articles/d41586-020-03217-0 


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